В средневековых текстах, имевших в известной мере естественнонаучный характер, естественнонаучное и образное видение мира как бы сливаются. Это не позволяет выделить в них собственно биологические знания. Поэтому о биологии в средние века можно говорить очень условно.
В это время наука вообще, и биология в частности, еще не выделились в самостоятельные области, не отделились от целостного религиозно-философского, искаженного восприятия мира. Средневековая биология — скорее отражение средневековой культуры, нежели отрасль естествознания с собственным предметом изучения.
Источниками сведений о биологических предприятиях в период раннего средневековья служат сочинения типа "Физиолога", "Бестиария" и т. п. В этих книгах содержались описания упоминаемых в Библии животных и фантастических чудовищ, а также рассказы по мотивам (весьма вольно истолковываемым) из жизни животных, целью которых были религиозно-нравственные поучения. "Физиолог" в рукописном виде имел хождение на многих европейских и восточных языках; в X—XI вв. он был переведен на славянский язык в Болгарии, откуда распространился и на Руси.
От сочинений этого типа мало отличаются и так называемые "Шестодневы", излагавшие -библейскую легенду о шести днях творения. Они возникли в первые века христианства. На Руси в X—XI вв. был распространен "Шестоднев" экзарха Иоанна болгарского, представлявший компиляцию из ранее созданных "Шестодневов" с привлечением сведений, взятых у античных авторов. В упомянутом сочинении приведена классификация животных, взятая у Аристотеля, но сильно упрощенная и искаженная. Так, в один "образ" (т. е. группу) животных, именно птиц, отнесены летучие мыши и летающие насекомые.
Сведения о животных и растениях содержались в "Поучении Владимира Мономаха" (XI в.), ходившем в списках на Руси, и других источниках.
Наиболее фундаментальными источниками сведений о биологических знаниях средневековья являются многотомные сочинения энциклопедического характера Альберта Великого и Венсана де Бове, относящиеся к XIII в. В энциклопедии Альберта Великого есть специальные разделы "О растениях" и "О животных". Детальные описания известных в то время видов растительного и животного царств во многом заимствованы у древних, главным образом у Аристотеля. Следуя за Аристотелем, Альберт связывал жизнедеятельность растений с "вегетативной душой".