Естественная систематика раньше других отраслей биологии проникла в ботанику; период естественных систем был открыт в 1789 г. классификацией А. Л. Жюссье. В те же годы создал свою систему растений Ламарк, перестроивший ее в 1803 г. Характеристика этих систем дана в главе 5. Следует отметить, что, несмотря на все свое эволюционное значение, классификация Ламарка не получила такого широкого распространения, как система Жюссье, ибо последняя была более детализирована и удобна для применения в ботанической практике.
Следующим шагом в развитии и оформлении естественной систематики явилась система О. П. Декандоля, которая была предшественницей системы Беитама и Гукера и также филогенетических систем Ч. Бесси и М. Г. Попова. Построение системы О. П. Декандоля в значительной мере напоминает первую систему Ламарка.
Система Декандоля. впервые была опубликована в его книге "Элементарная теория ботаники" (1813) и затем положена в основу наиболее полного по тому времени описания систематического состава раститель ного покрова Земли "Предварительная система растительного царства" (выходило в течение почти полувека, с 1824 по 1873 г.).
Частично система Декандоля была основана на анатомических представлениях того времени (деление на Exogenae — двудольные и Endogeпае — однодольные). Ее общий вид:
Весьма важным моментом в системе Декандоля было помещение двудольных в начале покрытосеменных, а многолепестных — в основание системы двудольных (таким образом, система Декандоля относится к так называемым "нисходящим", в отличие от "восходящей" системы Жюссье). Как оказалось впоследствии, взгляды Декандоля предвосхитили важнейшие положения ведущих филогенетических систем растений.
XX в. — монофидетизм покрытосеменных, их происхождение от многоплодниковых, вторичность "простоты" однопокровных. Однако следует помнить, что сам О. П. Декандоль отнюдь не истолковывал свою классификацию как филогенетическую, и многие из его сторонников понимали его систему в смысле, противоположном указанному — они предполагали, в частности, что поставленные им в начале системы многоплодниковые помещены туда не в силу всей примитивности, а наоборот, ввиду их "совершенства".